ワードプレスにて、グローバルナビゲーションのメニュー構造を変更しました。こ…

具体的にどのような構造変更を行ったかにもよりますが、単にグローバルナビゲーションのメニューを入れ替えたりした程度であれば、特に対応は不要です。
また記事への影響などの一切ありません。

もし心配であれば、Search Console にてサイト URL（ホーム）の URL 検査とインデックス登録リクエストと、サイトマップの再送信はやっておいてください。
必須ではないですし、これをやったからといって大きな影響が出るわけでもなく、やらなかったからといって問題が発生するようなこともありませんが。あくまでも念の為です。

とはいえグローバルナビゲーションの変更は、コンテンツの評価には多少なりとも影響は出てくる可能性もあります。

Google はコンテンツの評価を記事の内容だけでなく、ブログのデザインや使いやすさ（見やすさ）などのユーザビリティも含めて評価しているので、グローバルナビゲーションがユーザビリティを上げるような仕様になっているのであれば評価が上がりますし、ユーザビリティを下げてしまうような仕様になっているのであれば評価は下がります。

その判断を今すぐできるようなものではないですし、あくまでも今後の結果で判断するしかないですが。