All in one SEOというプラグインで、SEOの分析をすると、質問…

コンテンツの記事ページではタイトルに h1 タグが用いられるのですが、例えばトップページではコンテンツタイトル（ブログ名）、カテゴリページやタグページなどではカテゴリ名もしくはタグ名部分に h1 タグが用いられます。
記事一覧ページではその一覧の代表となる部分が h1 になり、記事タイトルは h2 になるんです。

なのでその記事一覧ページにて誤った h タグが利用されてしまっていてそれが「All in one SEO」に判定されてしまっているのかと思いきや、特に問題はなさそうですね。誤判定かもしれないですし、例えどこかのページで h1 タグが重複していたとしても、そこまで気にする必要はなさそうです。
とりあえず、記事ページにてしっかりと h タグを使用できていれば OK。そこまで気にする必要はないかと思いますよ。

すいません、前言撤回です。判明しました。
「All in one SEO」に × 判定されているのは、トップページですね。

トップページはコンテンツタイトル（ブログ名）に h1 が使われているのですが、記事一覧のカテゴリ名「新着記事」「ねこ」「ブログ」「アウトドア」にも h1 タグが使われています。なのでその部分「All in one SEO」によって × 判定となっています。

このカテゴリ名部分を h2 にするなど修正すれば、とりあえず × 判定はなくなるはずです。

そもそも、トップページのカテゴリ配置はどのように設定されているんですか？

何のテーマやプラグインを利用していてどんな設定にされているのか不明なので、具体的な設定はこちらではわかりませんが、おそらくはテーマファイルをカスタマイズする必要があるかと思います。

そもそも、雑記ブログのトップページにカテゴリ別の記事群をはいちする意味もあまりないので、トップページは単に新着順の記事一覧で良いとは、個人的に思います。記事数もたいして多くないですし、現在のカテゴリごとの記事配置はで単なる自己満足で、読者ファーストの観点から判断すると、あまり効果的ではないでしょう。

このように設定しています。
ややこしくてすみません。

なるほど！！読者ファーストですね！ありがとうございます。
修正します！
ながながとお付き合いいただきありがとうございました！！！

私個人的には「一覧（デフォルト）」で良いとは思いますが、どうしても「カテゴリごと」を利用したいのであれば、

①「All in One SEO」の判定は無視（SEO には何も影響しません）
②h1 タグを用いらないよう自身でカスタマイズ（もしくは外注）
③Cocoon 公式フォーラム（https://wp-cocoon.com/community/）で解決策を質問してみる

のいずれかになるかと思います。そもそも Cocoon のトップページカスタマイズ機能は今のところベータ版となるようなので、多くを求めるのも違うのかな、とは思います。また今回のようなある意味での不具合報告も、テーマ作成者は喜ぶのではないでしょうか。

@j_jetstream様
アドバイスにしたがい、トップページにカテゴリー分け表示をやめました。
タブ表示というのがあったのでそれにしてみました。
非常に勉強になりましたし、疑問も解決できありがとうございます。