ご 相談したいブログは　https://deepstoryjapan.com/…

＞ブログ初心者で、公開した直後のブログのページをインデックス登録した後に、受信した２件のメールで指摘された問題を解決したく、お知恵をお借りできればと思います。
▶クリエイター側はインデックス登録リクエストしかできないと思うのですが、どのようにしてインデックス登録を行ったのでしょうか？その方法を開示できますか？

＞インデックス登録に際し、「sitemap.xml」を送信する方法で登録を試みましたが、エラーメッセージが出てうまくいかない為、
▶Search Console の話かと思いますが、【「sitemap.xml」を送信する方法で登録を試み】は、Search Console の「インデックス作成」→「サイトマップ」→「新しいサイトマップの追加」の手順で XML サイトマップを送信しようとしたにも関わらずエラーが出たということで合っていますか？
XML サイトマップ「https://deepstoryjapan.com/sitemap.xml」はちゃんと存在しているので、「新しいサイトマップの追加」にて入力ミスか何かをされていると予想されます。

＞方針を変更し、URL検査でページのURLを入力して登録されていないことを確認したうえで、登録をリクエストすることにしました。翌日に登録されたことを確認しました。
▶「URL検査でページのURLを入力して」は、一体何の URL を入力したのでしょうか？ドメインや記事 URL など、個別の URL ですか？もしかして、XML サイトマップの URL ですか？
文章全体的に修飾語が曖昧なため、状況を把握しきれません。

＞そこにはGoogleの選択は「https://deepstoryjapan.com/」、ユーザーの指摘が「https://deepstoryjapan.com/site-map/」とありました。～ 思い待つことにしました。
▶「更にURL検査を使って、ブログ全体のURLの登録をリクエストしたことで、」にて、URL 検査からインデックス登録リクエストを行った具体的な URL は何でしょうか？

＞ブログ全体のURLの登録をリクエストしたことで、ユーザーの指定が「https://deepstoryjapan.com/site-map/」というdataとして残ってしまい、問題を招いたのではないか判断しました。
▶「ブログ全体のURLの登録」はおそらく、インデックス登録リクエストのことかと予想されますが、あくまでも「リクエスト」です。それを行ったことで、必ず指定の URL がインデックスされるわけではありません。
インデックス登録リクエストを行った URL が Search Console 側で「正」として認識されるわけではなく、あくまでもそのドメインにおける構造を元に URL が認識されます。
要は、その判断（認識）は間違っています。

＞そこでサーチコンソールのサイトマップを削除したところ、「エラーの修正を検証しています」のメールが来ました。対処法が正しかったのかなと思い待つことにしました。
▶削除したサイトマップ（XML サイトマップ）の URL は何ですか？

＞一晩待ったところ、３．と同じメールを再度受信し、修正が完了していない状況を知りました。状況判断を誤ったものと思われます。修正方法をご教示いただければ幸いです。
▶「修正方法」とおっしゃられていますが、結局何をしたいのかがよくわかりません。Search Console にサイトマップ（XML サイトマップ）を登録したいのか、URL 検査からインデックス登録リクエストを行いたいのか、Search Console におけるエラーを修正したいのか。一体何でしょうか？

＞４と同じタイミングで別メールにて、「https://deepstoryjapan.com/sample-page/」失敗しました: 見つかりませんでした（404）といエラーメッセージを受信しました。WEB固定ページを確認しましたが、固定ページ一覧にはsample pageは存在しませんでした。１．の時点では指摘されていなかった問題です。対処方法をご教示いただければ幸いです。
▶サイトマップを登録していた当初に残っていた URL と予想されます。すでに消したか何かで存在しない URL なのかと思いますが、特に対処方法はありません。存在しない URL なのであれば、そもまま放置で問題ありません。

前述の通り、ご質問全体的に修飾語が曖昧なため、詳細な状況がわかりません。
またなんとなくですが、「サイトマップ」と「XML サイトマップ」の違いや、インデックスの意味を理解されていないようにも伺えます。

結論として、ebihara.sa.3104@gmail.com さんにとって何がゴールなのかを教えてください。

@j_jetstream様

ご連絡ありがとうございました。説明が曖昧で申し訳ございません。ゴールは、次の２点です。
① https://deepstoryjapan.com/　傘下のページがGoogleに登録された状態にすること
②メールで指摘された以下の２つ問題を修正すること。

（問題１）
検出 - インデックス未登録というメッセージで、https://deepstoryjapan.com/の傘下の19のURL（前回のクロール：該当なし）と表示されています。
（問題２）
重複しています。Google により、ユーザーがマークしたページとは異なるページが正規ページとして選択されましたというメッセージで、ユーザーが指定したURL:https://deepstoryjapan.com/site-map/, Googleが選択したURL:https://deepstoryjapan.com/と表示されています。

ちなみに、たった今、URL検査で、https://deepstoryjapan.com/の登録の有無を問い合わせると以下のように表示されます。
（URL検査のページの表示）
●URL は Google に登録されています
●関連するすべての拡張機能とともに Google 検索結果に表示されます
●ページのインデックス登録：ページはインデックスに登録済みです
●拡張機能とエクスペリエンス
●モバイル ユーザビリティ：ページはモバイルで利用できます
●パンくずリスト：1 件の有効なアイテムを検出しました
●サイトリンク検索ボックス：1 件の有効なアイテムを検出しました

尚、ご質問への回答は以下の通りとなります。
１．【インデックス登録の方法】：サーチコンソールの「URL検査」を使い、https://deepstoryjapan.com/　を登録リクエストして登録したことを「インデックス登録」と表現しました。
２．【「sitemap.xml」を送信する方法で登録】
→おっしゃる通りです。https://deepstoryjapan.com/まで表示されている後ろのブランクにsitemap.xmlと入力して送信しました。記憶が不明瞭ですが、●●行目のタグが●●　というようなエラーメッセージが出ました。いろいろ調べましたが、対応策が分からなかったので、「「sitemap.xml」を送信する方法」による登録を諦めました。
３．【「URL検査でページのURLを入力して」は、一体何の URL】：https://deepstoryjapan.com/を入力してリクエストました。数時間して登録できたか確認したら「URL は Google に登録されています」と表示されました。前記の通り。
４．【URL 検査からインデックス登録リクエストを行った具体的な URL 】：https://deepstoryjapan.com/です。
５．【削除したサイトマップ（XML サイトマップ）の URL 】：「サイトマップ」のページの「送信されたサイトマップ」をクリックし、オプションから「サイトマップの削除」のボタンを押して削除しました。
　具体的なURLを指定していませんが、https://deepstoryjapan.com/sitemap.xmlを削除した認識です。
６．【したいことは何か？】上記の問題１，２を解決し、「エラーは修正された」という確認のメールをGoogleから受けることです。「サイトマップの削除」をした理由は、「重複登録された」という問題が発生した時の対処方法として、不要なページを削除して、Googleが正として選択したものを残す方法が複数のブログなどで紹介されています。そこで、前述のように、ユーザーが指定したURLがhttps://deepstoryjapan.com/site-map/であれば、これを削除すれば、Googleが正としたものだけが残るのではないかと考えたのです。
７．【存在しない URL なのであれば、そもまま放置で問題ない】：承知いたしました。

最後に：
ご指摘の通り、本件は、google登録に関する私の用語や仕組みへの理解不足が原因となっていることが原因なのは間違いありません。大変お手数をおかけして誠に申し訳ありませんが、お知恵を貸していただけないでしょうか。
どうぞ宜しくお願い申し上げます。